Nuova ricerca: identificare potenziali bersagli per farmaci che potrebbero funzionare contro tutti i coronavirus
I farmaci spesso si legano alle tasche interne delle proteine che trattengono il farmaco comodamente, facendolo interferire con la funzione della proteina. Gli scienziati possono identificare potenziali tasche che legano i farmaci dalle strutture 3D delle proteine virali.
Hanno riportato i loro risultati nel Journal of Proteome Research dell'American Chemical Society. La possibile comparsa di varianti SARS-CoV-2 resistenti ai vaccini, così come di nuovi coronavirus, rende importante trovare trattamenti che funzionino contro tutti i coronavirus.
Ora, i ricercatori hanno analizzato le proteine virali di 27 specie di coronavirus e migliaia di campioni di pazienti affetti da Covid-19, identificando sequenze altamente conservate che potrebbero costituire i migliori bersagli farmacologici. Hanno riportato i loro risultati nel Journal of Proteome Research dell'American Chemical Society.
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I farmaci spesso si legano alle tasche interne delle proteine che trattengono il farmaco comodamente, facendolo interferire con la funzione della proteina. Gli scienziati possono identificare potenziali tasche che legano i farmaci dalle strutture 3D delle proteine virali. Nel tempo, tuttavia, i virus possono mutare le loro tasche proteiche in modo che i farmaci non si adattino più.
Ma alcune tasche che legano i farmaci sono così essenziali per la funzione della proteina che non possono essere mutate e queste sequenze sono generalmente conservate nel tempo nello stesso virus e nei virus correlati.
Nello studio, il ricercatore Matthieu Schapira e colleghi volevano trovare le tasche leganti i farmaci più altamente conservate nelle proteine virali da campioni di pazienti Covid-19 e da altri coronavirus, rivelando gli obiettivi più promettenti per i farmaci pan-coronavirus, ha affermato l'American Chemical Society. in un comunicato stampa sulla ricerca.
Il team ha utilizzato un algoritmo informatico per identificare le tasche che legano i farmaci nelle strutture 3D di 15 proteine SARS-CoV-2. I ricercatori hanno quindi trovato le proteine corrispondenti in 27 specie di coronavirus e hanno confrontato le loro sequenze nelle tasche che legano i farmaci.
I due siti drogabili più conservati coinvolgono proteine (chiamate rispettivamente nsp13 e nsp12) che sono coinvolte nella replicazione e trascrizione dell'RNA virale.
I ricercatori hanno affermato che nuovi farmaci antivirali mirati al sito catalitico della proteina nsp12 sono attualmente in sperimentazione clinica di fase II e III per Covid-19 e che il sito di legame dell'RNA di nsp13 è un bersaglio precedentemente inesplorato che dovrebbe essere un'alta priorità per lo sviluppo di farmaci. .
Fonte: American Chemical Society
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